湖南省儿科医学研究所是湖南省儿童医院在建设发展过程中，在中心实验室和医院儿科研究所的基础上建立起来的，2002年经省卫生厅批准成立，2003年6月1日由省人民政府甘霖副省长和省卫生厅刘家望厅长亲自揭牌。它既是湖南省儿童医院的医学科研基地，也为全省的儿科临床科研工作者提供科研技术平台。儿研所具有良好的研究条件，有一支相对稳定，团结协作的技术队伍和科研人员。现设有八个研究室，聘请周宏灏院士担任首席科学家，拥有博士后、博士、硕士为主体的研究人员。2006年被人事部批准为“博士后科研工作站”，现已有博士进站工作。

　　儿研所内设有基础研究室、遗传与基因研究室、血液病研究室、皮肤病研究室、肾脏病研究室、急救医学研究室、外科学研究室、新生儿医学研究室、消化系统疾病研究室、临床药学研究室。基础研究室内下设病理实验室、细胞培养室和SPF动物实验室，遗传与基因研究室内下设临床基因扩增检验实验室及分子生物实验室、遗传代谢性疾病诊断实验室。2003年10月临床基因扩增检验实验室在省内率先通过卫生部的达标验收，2004年SPF动物实验室在省内第一批通过湖南省科技厅验收，成为全省唯一持有SPF 实验动物使用许可证的临床单位。

　　儿研所拥有一批现代化的先进科研设备，有用于分子生物学研究的美国进口荧光定量PCR仪，及可进行原位杂交的定性基因扩增仪、高速冷冻离心机、冷热循环水浴仪;用于细胞培养的进口倒置显微镜、三气CO2培养箱及二级生物安全柜;进行SPF动物实验的VIC笼具;用于血液学骨髓、遗传染色体、病理及肾病病理分析用的两台图文分析系统;用于病理学研究的冷冻切片机和荧光显微镜、病理样本快速超声处理仪;用于变态反应研究的全自动进口过敏原检测仪;用于血清、血红蛋白、脑脊液蛋白等分析的进口全自动蛋白电泳仪;用于先天性代谢疾病检测的液相色谱/质谱联用仪。

　　儿研所是集科研和临床试验于一体的综合性实验平台，儿研所不仅承担科研工作还开展了许多临床特殊检测。儿研所的遗传与基因研究室开展了染色体常规显带技术及高分辨显带技术，开展了一些代谢性疾病的常规检查如微拄法尿17—羟皮质醇测定及17-酮类固醇测定等;开展了脆性X检查，SRY基因检测，HBV-DNA荧光定量，CMV荧光定量检测，胰岛素生长因子1(IGF-1)及胰岛素生长因子结合蛋白-3(IGFBP-3)的检测等;可承接遗传代谢、分子生物学及液相色谱/质谱有关的各类研究课题。血液病研究室主要以开展血液学临床检测工作为主，可承接各类血液学方面的临床研究，开展了骨髓形态图文分析，骨髓特殊染色及酶组织化学染色，新生儿葡萄糖6-磷酸脱氢酶缺乏症筛查，地中海贫血等溶血性贫血检测，血红蛋白全自动电泳分析，基础研究室开展了临床病理学诊断，免疫组织化学及各种特殊染色，呼吸道病毒、肠道病毒等抗体测定，TORCH全套检测：能承接有关细胞培养、动物实验、病理学等方面的课题。肾脏病研究室是目前我省为数不多的儿童肾脏病专科研究室，结合临床开展了肾穿刺活组织检查的肾脏病理组织快速切片、肾组织免疫荧光检测，开展了视黄醇结合蛋白含量测定，尿微量蛋白分析等用于诊断肾脏疾病的多项临床检测，可承接与之相关的各类研究课题。皮肤病研究室开展了梅毒确诊和筛查试验如TRUST 、TPPA ，解脲人型支原体培养和药敏，衣原体金标检查等，还开展了吸入类、食物类变应原荧光免疫检测特异性IgE筛查(Phad、fx5E)和43种吸入类、食物类、其他化学类变应原单项特异性IgE 检测及总IgE、嗜酸细胞阳离子蛋白(ECP)等多项检测，能承接各类相关的研究课题。临床药学研究室是目前我省唯一的儿童专科药学研究室，研究室内开展了卡马西平、苯巴比妥、安定、丙戊酸钠、苯妥英钠、氯硝安定、硝基安定、茶碱、万古霉素、甲氨蝶呤等药物的血药浓度检测，并进行药物质量控制，可承接各类相关的研究课题。急救研究室开展了细胞因子检测及相关的临床研究、消化系统疾病研究室开展了和本专业相关临床检测工作和研究工作。

　　儿研所承担了厅级、院级课题70多项，其中儿研所内申报的课题10余项，儿研所在各种核心期刊上发表学术论文20多篇，其中有一半发表在中华级杂志上。儿研所遗传研究实验室发现世界首报染色体核型四例，发现少见罕见染色体核型近100例，这些发现对人类研究遗传性疾病具有重大意义。