内窥镜室现有副主任医师1名、主治医师2名、主管护师1名，护师1名，护士2名，拥有目前最先进的OlympusXQ-260 OlympusXQ-240 及V-70电子胃镜、CF-260I，CF-240I及V-70电子结肠镜、EREB ICC200高频电刀等全套设备，全部检查图像由电视显示，报告由电脑打出彩色照片，方便医生给病人治疗和复查。
除日常的胃镜和肠镜检查外，科室还开展了急诊胃镜、肠镜检查、消化道异物取出、食道贲门狭窄扩张治疗、贲门失驰缓症气囊扩张治疗、消化道出血的内镜下止血治疗、幽门螺旋杆菌(Hp)检测等。
此外还开展多种高难度内镜下治疗技术，如胃肠道息肉的高频电摘除术及尼龙圈套扎术、粘膜剥脱术（EMR）、食管静脉曲张套扎术（EVL）、食管狭窄的支架放置术、内镜下经皮胃肠造瘘术、内镜下鼻空肠管置放术等，具有创伤小、痛苦小、术后恢复快等特点。此外色素内镜的开展可检出常规内镜不能发现的早期肿瘤病变，提高早期癌的检出率，而无痛内镜则消除了患者的痛苦和对内镜诊治的恐惧感。
