1994年10月，医院成立脑外科，由蒋建华副主任负责，季晓红任护士长，医生2名，护士12名，展开床位20张。

    1994年～2003年，脑外科作为独立的科室，抢救了大量的交通事故以及工伤事故伤员。每年收治的病人在500人次以上，每天脑外科住院病人平均40例左右，每年手术达100例以上，创造了显著的社会效益。科室曾在镇江市电视台正大博览栏目作了近半个小时的专题介绍，蒋建华主任荣立三等一次。脑外科建科以来，开展了很多颅脑肿瘤及脊髓肿瘤的手术治疗，成功的施行了如垂体瘤、桥小脑角肿瘤、蝶骨嵴脑膜瘤、天幕脑膜瘤、胶质瘤及脊髓肿瘤、颈椎蛛网膜囊肿等切除术，开展了脑室腹腔分流及颅骨缺损修补手术，与口腔科合作开展科研，取得了军队科技成果三等奖1项。

    2003年6月，陶存山担任科主任后，成立了神经形态学实验室，在博士课题研究的基础上，继续进行相关课题研究，申请的2项医院管理课题《小脑幕切迹的显微解剖研究》《亚低温在重型颅脑创伤中的临床应用研究》获得立项。先后在临床上应用亚低温成功救治重型颅脑创伤病人50余例，取得了良好的治疗效果。是年12月，购置美国PB-760呼吸机1台。

    2004年起，脑外科在医院党委的支持下，聘任了神经外科专家，使科室医疗力量得到加强。在脑外伤救治的基础上，脑外科相应地开展了脑血管病、脑肿瘤、癫痫等外科治疗，取得了良好效果。

    2005年后，脑外科先后开展了颅骨重建对神经功能影响的研究；总结了复发脑胶质瘤再手术的时机及对生存质量的影响；对重型高血压基底节区出血采用显微外科手术治疗，取得了较好效果。2006年10月，购置了国产心电监护仪2台、德国MOLLEH神经外科专用手术显微镜1台，开展重型颅脑损伤的救治、脑肿瘤、脑血管疾病、癫痫的治疗以及脑外科各种危重病人的抢救。陶存山担任镇江市神经外科专业委员会委员、南京科学技术委员会神经外科专业委员会委员、《解剖与临床》杂志青年编委。开展科研课题2项，在国内医学核心期刊上发表学术论文22篇，1人荣立三等功。