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江苏省新生儿疾病筛查中心盐城分中心于2002年经江苏省卫生厅依法许可建立，负责全市新生儿疾病筛查行政管理、业务指导和阳性患儿的诊疗工作。分中心下设新生儿疾病筛查管理办公室、新筛实验室和诊疗室，共有卫技人员8名，其中高级职称1名，中级职称6名。
新生儿疾病筛查是通过特定的实验室对某些能够导致新生婴儿体格、智能发育障碍的先天性代谢性疾病及内分泌病进行群体筛查，使它们在临床症状尚未表现之前得以早诊断、早治疗，从而避免重要脏器，如脑、肝、肾不可逆的损伤所导致的生长及智能发育的落后。8年以来，在全市已筛查新生儿近40万，共查出阳性患儿365例，其中先天性甲状腺功能减低症（CH） 308例，苯丙酮尿症（PKU）57例。通过筛查，使这些患儿得到了及时的治疗，为提高全市出生人口素质作出了积极的贡献。
