我院男科创建于1988年，二十年来，男科工作逐步走上规范化的健康发展道路。男科的宗旨是为了提高男性生殖健康水平，规范男性疾病的诊治而加强人才培养，推动科研创新，赶超国内先进水平。
近年来，完成《少弱精患者精浆中端粒酶和端粒酶逆转录酶的实验研究》科研一项，由甘肃省自然科学基金资助。完成《男性生殖影响因素与干预》专著一部。发表科研论文十五篇。男科实验室开展精子形态评估、精子存活率分析、精浆抗精子抗体、精浆生化等新技术新项目。
男科现有工作人员五名，副主任医师2名，住院医师2名，检验师1名。保证每天有专家门诊。
男科每年接诊患者四千余人次，疾病种类包括男性不育、前列腺疾病、性功能障、生殖系感染、性转播疾病、生殖器发育异常、婚前检查、孕前生殖健康体检、男性更年期综合征等疾病。男科门诊力求缩短时间，保证患者医疗需求，得到了广大患者的信赖。
