外三科以肝胆外科、泌尿外科为主，尤以肝胆外科为主要方向，现有医护人员17名，其中主任医师1名，副主任医师1名，主治医师1名，住院医师4名，护理人员10名。有床位40张。肝胆外科于1996年12月建科，主要收治肝、胆、胰疾病患者。中国科学院院士、外科学界泰斗──裘法祖教授为科室题名“肝胆外科中心”。“中心”成立以来，已成功开展腹腔镜胆囊切除术4千余例，成功施行各种复杂肝内外结石手术、肝脏各段叶肿瘤切除手术千余例，从2002年起完成了5例改良背驮式原位肝脏移植手术，全部成功，至今患者存活良好,在国内属领先地位。泌尿外科自2002年起完成了3例亲属活体供肾移植和5例同种异体供肾移植手术，全部成功，至今患者存活良好,在国内属领先地位。引进瑞士气压弹道碎石机，临床治疗输尿管结石百余例，均获成功，避免了常规切口手术，是微创碎石和取石的最佳途径。引进德国前列腺电切镜，开展经尿道前列腺切除手术百余例，前列腺电切镜技术损伤小、恢复快，被誉为治疗前列腺增生症的“金标准”，深受病人称赞。肝胆外科、泌尿外科多次获得扬州市科技进步一等奖、扬州市卫生局科研成果一等奖、江苏石油勘探局科研成果一等奖。在省级以上刊物上发表学术论文20余篇。