宝兴县中医医院始建于1989年,当时医院位于宝兴县城兴宝北街，占地面积约1亩，是一所集医疗、教学、科研、康复、预防、保健为一体的综合性县级中医医院；是宝兴县各类医保的定点医疗机构，当时设置床位20张，人员编制15人。在多轮医改浪潮中，1999年12月(31日)与宝兴县人民医院合并,组成宝兴县医疗救治中心，2008年因创全省中医工作先进县,宝兴县中医院分离出现医疗救治中心,迁入宝兴县灵关镇,挂牌于宝兴县灵关镇中心卫生院,形成一个机构，两个牌子的格局，中医院仍然按照20张床位，15个认得编制核定，灵关中心卫生院编制为30张床位，30个人员编制，两院合并办公，人员、设施共用。2010年全省中医先进县创建顺利完成。随着医改政策的深入发展,结合“5.12”地震灾后重建机遇，2011年12月，宝兴县中医医院分离出灵关镇中心卫生院，正式迁入5.12后重建在灵关镇新灵街72号的医院，划分编制后增至床位60张，人员15人，于2012年人员扩编为30人，目前编制50人。

“5.12”后，新建医院占地面积4669平方米，业务用房面积4896平方米，编制床位60张，编制人员30个，实际人员46人，其中单位自聘10人。4.20后，医院房屋因损毁严重，经鉴定，为“c级”损坏，建议加固维修，降级使用，不作为医疗用房。抗震救灾过程中，中石油援建活动板房1600平米用于医院日常业务工作，目前，医院仅维持于活动板房内开展日常业务，为区域内老百姓提供基本医疗服务。

目前全院职工62人，其中含在职在编47人，特需人才2人。职称结构：高级职称6人，中级职称11人，初级职称34人,其他自聘11人（按同类别等级聘）；有一人获得“省名中医”称号;一人获”宝兴县名中医”称号。4.20后，各级领导立足于发展、民生需要，以前瞻性思维，最终核定床位编制200张（人员因事业单位人事改革暂冻结编制原因未予调整编制）,目前仍然按照60张床位，实际开放40张开展工作，拟结合宝兴实际，借灾后重建之机，按照科学规则、前瞻定位的原则，重建一所环境优美、队伍稳定、技术水平较高、能为区域内人民提供以中医药特色服务为主的基本医疗健康服务的综合性中医医院。

4.20”芦山强烈地震中，宝兴县中医医院受损严重，4896平米的业务用房，直接受损3480平方米，设备受损200余台件。现有彩超、cr、全自动生化仪、血球分析仪、胃镜、牵引床等500多万医疗设备。