包头医学院第二附属医院建院于1951年，历经60多年的蓬勃发展，现为一所集医疗、教学、科研、康复、急救、预防、保健于一体的大型三级乙等综合医院。占地面积4万平方米，建筑面积10万平方米，开放床位700张。2017年新内科综合病房楼投入使用后，开放床位将达到1000张。现有职工1089名，其中副高级以上专技人员270名，硕士生导师19名，博士生8名，在读博士3名，硕士135名，享受国务院特殊津贴专家2名，自治区学科带头人2名，自治区“321”工程人才3名，自治区“草原英才”1人，自治区、包头市名中医2名，包头市名医、后备名医人才5名，包头市“5512”创新人才3名，包头市鹿城英才3名，内蒙古自治区“草原英才”工程产业创新人才团队2个，包头市“5512”创新团队2个。
医院有专业技术科室40余个，其中自治区领先和重点学科3个(消化内科、急诊医学科、心内科)﹔自治区中医特色重点建设专科1个(针灸科)﹔包头市领先和重点学科7个(消化内科、急诊医学科、皮肤性病科、眼科、呼吸科、肾内科、针灸科);自治区质量控制中心2个;自治区级研究所2个;包头医学院硕士研究生培养点6个;自治区临床路径管理试点科室1个;自治区卫生厅规范化性病门诊示范点1个。拥有瑞典医科达直线加速器、西门子128层4D螺旋CT、飞利浦1.5T核磁共振、奥林巴斯290电子胃肠镜、超声小探头、富士能电子胃肠镜、超声内镜、鼻胃镜、双气囊小肠镜、飞利浦X光胃肠ERCP机、磁控胶囊内镜、SPYGLASS、海博刀、C型臂、DR等先进的诊疗设备，为医院的发展和医疗服务提供了有力地保障。医院坚持以内涵建设为重点，加强学科和专科专病建设，积极开展新业务，成功开展了逆行胰胆管造影及相关治疗(ERCP)、内镜下消化道肿物切除（ESD、POEM等)、内镜逆行性阑尾炎治疗(ERAT)、内镜下止血(静脉曲张治疗等)、磁控巡航胶囊检查;经皮冠状动脉介入治疗(PCI);冠状动脉旁路移植术;腹腔镜下半肝切除术、胃底折叠术;经骶尾部切口直肠间质瘤切除术;腹腔镜下肾癌根治术、输尿管软镜加激光治疗输尿管结石、肾结石;肌皮瓣转移修复软组织缺损;HPV病毒PCR分型检测、乙肝病毒荧光定量检测、各种传代细胞、原代心肌细胞培养技术、Western-blot蛋白半定量检测技术、Real-time PCR 总RNA及MicroRNA定量检测等重点业务和技术，为我院的学科建设和临床研究奠定扎实的基础。
医院坚持科技创新，加大科研经费的投入力度，科研成果丰硕。近几年科研立项196项，其中国家自然基金项目5项，自治区自然基金项目15项，自治区科技厅计划项目及内蒙古卫计委、高等学校科研项目23项。获自治区级奖项16项，包头市级奖项14项;发表核心期刊论文108篇，SCl论文9篇。
近年来，医院积极探索现代医院管理与运营理念，围绕“质量、安全、服务、绩效”的管理主题，在服务能力、学科建设、人才培养、技术创新等方面成绩显著，医院各项工作稳步发展。医院先后被确定为国家“爱婴医院”、“全国百姓放心示范医院”、“国际SOS救援中心合作医院”、国家消化系统疾病临床医学研究中心、“一带一路‘友谊’消化内镜直通车万里行”内蒙古总站、自治区首批住院医师规范化培训专业协同基地等。并荣获自治区“文明单位”、“文明医院”、“自治区高校工委先进基层党组织”、中国医院协会“第四届全国医院文化建设先进单位”等荣誉称号。