鄂尔多斯市妇幼保健院建于1959年，属财政全额拨款事业单位，为市卫生局直属二级单位。负责全市妇幼保健业务技术指导、培训监督、信息统计、健康教育，是一所开展妇女、儿童群体保健业务并与临床相结合的妇幼保健院。

多年来，市妇幼保健院在市委、市政府及相关领导部门的关怀和支持下，在院领导班子的带领下，全院职工团结奋斗，艰苦创业，使保健院的知名度得到提升，业务量成倍增加，妇幼卫生事业不断发展。我院现有职工130人，其中卫生专业技术人员98人，设计床位150张。鄂尔多斯市妇幼保健院1995年取得世界卫生组织、联合国儿童基金会、卫生部授予的“爱婴医院”称号。2008年10月，我院成为鄂尔多斯市首家 “中国初级卫生保健基金会爱心医院”。近年来还先后获得自治区三八红旗先进集体、鄂尔多斯市工作业绩突出单位、市级精神文明单位、鄂尔多斯市社会治安综合治理优秀单位、市红十字会先进会员单位、市总工会先进单位等荣誉称号。

我院自2009年2月起，先后引进了韩国麦迪逊实时三维X8彩色多普勒超声设备、美国产流式点阵仪（肿瘤筛查系统）、全自动生化分析仪等多部先进仪器。2011年我院又引进了DNA倍体分析系统及飞利浦IU22彩色B超等多台B超设备；2012年后又陆续匹配了TALENT-Ⅱ时间分辨荧光免疫新生儿筛查分析系统（包括TALENT-Ⅱ时间分辨荧光免疫分析仪、荧光免疫分析仪等）、微量元素分析仪博辉5500、尿液分析仪Uritest-500B、全自动五分类血球计数仪迈瑞5800等先进设备；扩展了儿童体检项目，新增了儿童视力检查仪、儿童耳蜗精灵及骨密度检测仪等仪器。2014年，我单位被市卫生局定点为全市新生儿遗传代谢疾病筛查单位，主要筛查的是苯丙酮尿症和甲状腺功能低下两种疾病。

目前，我院全体医护人员在院长的带领下正努力拼搏、不断创新，力争将鄂尔多斯市妇幼保健院打造成我市专业、权威的妇女儿童医院。