鄂尔多斯市中心医院始建于1950年，是鄂尔多斯唯一的三级甲等综合医院，是内蒙古医科大学临床医学院，成立了内蒙古自治区超声影像研究所，是自治区超声质量控制中心，拥有国家级临床重点建设专科重症医学科和自治区领先学科超声医学科。
医院是国家临床药师培训基地和国家住院医师规范化培训基地。建立了国家消化疾病临床医学研究中心分中心、京蒙合作消化疾病医疗中心、胸痛中心、心衰中心、头痛中心、卒中中心。影像医学、超声医学等专业水平居于自治区先进地位。消毒供应中心是自治区实践基地。神经专业、肿瘤专业、心内专业、呼吸专业成为自治区临床医学研究中心核心成员单位。
医院设置康巴什部和东胜部，总建筑面积26万平方米，开放床位1700张。拥有PET-CT（最新数字PET）、宝石CT、3.0T核磁共振、彩超、血管造影机等先进医疗设备。
医院近三年先后获评全国“全国卫生计生系统先进集体”“中国医院百强院”“自治区平安医院示范单位”等荣誉称号。
