宝应县妇幼保健所建于1953年4月；2004年11月，增挂“妇幼保健院”——明确“以保健为中心，保健与临床相结合”的发展方向。2010年1月经扬州大学医学院评定为扬大医学院教学医院；2012年9月我院顺利通过江苏省二级甲等妇幼保健院评审；2012年我县成为全省首批、全市首家妇幼卫生先进县；2016年11月增挂“宝应县妇幼保健计划生育服务中心”；2019年12月增挂“宝应县儿童医院”。经过近几年快速发展目前已成为一所集保健、医疗、教学、科研于一体的妇幼保健院。

医院占地面积9500平方米，建筑面积18000平方米；开放床位200张。现有职工338人，其中卫生技术人员281人，研究生学历6人，本科学历215人，高级职称51人，中级职称70人。

医院始终坚持保健与临床相结合的宗旨，依照全生命周期和三级预防的理念，构筑起以孕产保健部、儿童保健部、妇女保健和计划生育技术服务部3大业务部门为基础的，大保健医疗服务与管理模式。妇科、产科、儿科、检验科先后创成扬州市临床重点专科。住院分娩占全县分娩总数的75%，儿科业务量占城区医疗机构的一半。

先后获得国家妇幼健康服务工作先进单位、江苏省模范职工之家、“江苏省公共机构节能示范单位”、“省级青年文明号”、扬州市文明单位称号、扬州市文明服务示范窗口称号、扬州“三八”红旗集体荣誉称号、扬州市十佳“六有”基层工会标兵单位、扬州市五一劳动奖状、扬州市“春蕾计划”“蒲公英行动”先进集体等荣誉称号。