主要用于对抗金黄色葡萄糖球菌，临床上如果出现甲氧西林耐药菌株，那么万古霉素几乎是唯一选择，因此，该药在抗生素中的地位是不可替代的，临床上观察副作用并不多，还是比较安全有效的。
去甲万古霉素适用于葡萄球菌属(包括甲氧西林耐药菌株对本品敏感者)所致心内膜炎、骨髓炎、肺炎、败血症或软组织感染等。万古霉素课用于对青霉素类过敏者，口服可用于治疗伪膜性结肠炎和消化道感染。去甲万古霉素的毒性比较大，有很严重的耳毒性，连续用药数天课引起耳鸣、听力减退、甚至耳聋及早停药可以恢复正常。万古霉素还有肾毒性，主要损伤肾小管，表现为蛋白尿和管型尿、少尿、血尿甚至肾功能衰竭。快速静注的时候，出现过敏反应，皮肤极度潮红、红斑、荨麻疹等症状。
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