1.菌痢 为脓血便、黏液多，次数频繁，有里急后重，大便培养可发现痢疾杆菌。
2.肠炎 如沙门菌、鼠伤寒，致病性大肠埃希菌等肠炎，婴儿期发病，大便培养可发现致病菌。
3.腹型过敏性紫癜 有反复出血及皮肤紫癜，无腹泻。
4.急性肠套叠 婴幼儿多见，腹部可摸到肿物，钡或气灌肠可以确诊和复位。
5.绞窄性机械性肠梗阻 为完全性肠梗阻，X线立位平片见有高张力肠积气的液平面及结肠无气，与肠炎的X线征不同。
6.克罗恩病 为消化道慢性复发性炎症，病理变化除有嗜酸性粒细胞、浆细胞、淋巴细胞浸润外，并出现肉芽肿样改变，可形成肠腔狭窄，内瘘及粘连。
