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  控制冈比亚锥虫病的基础,是普查并治疗大量的无症状感染者,特别是淋巴结肿大者,同时治疗患者及加强管理家畜。可采用“香味”诱扑机扑杀采采蝇,1次可扑杀数千克,是减少采采蝇威胁的非常有效的方法;又因为采采蝇容易反复,故需1次/6个月。因为冈比亚锥虫病的潜伏期长,而致不易及时看到其发病率减少的效果。近来在乌干达罗得西亚锥虫病的流行区有用采采蝇诱扑机,得到成功的经验。因为罗得西亚锥虫病潜伏期较短,致使能及时看到它被控制的效果。进入未经处理的采采蝇滋生地区时,应加强个人防护。包括穿长袖上衣和长腿裤,穿着明亮色彩的衣服,睡眠时用蚊帐,使用驱虫剂等,均可防御采采蝇的侵袭。至于采用喷他脒作为化学预防,尚未得到统一的看法。

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