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　　1.慢性细菌感染 多次粪便常规及培养有阳性发现，以及充分有效地抗生素系统性治疗，症状改善明显，可明确诊断。

　　2.慢性阿米巴痢疾 多次大便找阿米巴及甲硝唑试验治疗可明确诊断。

　　3.血吸虫感染 血吸虫疫区病人可作乙状镜检查，取直肠黏膜找血吸虫卵，或用粪便孵化法和其他方法加以鉴别。

　　4.吸收不良综合征 有腹泻，但大便中常有脂肪和未消化食物。

　　5.肠肿瘤 小肠的良性小肿瘤可发生腹泻和间歇性发作的部分肠梗阻。结肠肿瘤也可以出现类似肠道功能性疾病的症状。特别是对老年人应注意。可进行X线钡剂造影检查或结肠镜检查以明确诊断。

　　6.溃疡性结肠炎 有发热、脓血便等异常表现。经X线钡剂造影或结肠镜检查可以鉴别。

　　7.克罗恩病 常有发热、贫血、虚弱等全身症状。X线钡剂造影或结肠镜检查即可鉴别。

　　8.乳糖酶缺乏 乳糖耐量试验可以鉴别。乳糖酶缺乏有先天和后天之分。临床表现为吃乳制品后有严重的腹泻，大便含有大量泡沫和乳糖、乳酸。食物中去掉牛奶或奶制品，症状即可改善。酸牛奶经乳酸菌将乳糖分解，可供这类病人食用。

　　9.胃肠道内分泌肿瘤 促胃液素瘤可出现严重的腹泻和顽固的溃疡病，血清促胃液素水平极高，一般治疗无效。血管活性肠肽瘤(Vipoma)也引起严重腹泻;血清VIP水平增高。

　　10.甲状腺疾病 甲状腺功能亢进可出现腹泻。甲状旁腺功能亢进可出现便秘。可作甲状腺、甲状旁腺功能检查以进行鉴别。

　　肠易激综合征(IBS)的诊断标准 　　在过去，对IBS的表现曾有过很多医学名称，如神经性结肠炎、过敏性结肠炎、结肠痉挛、粘液性结肠炎、结肠功能紊乱等，但这些名称大多数定义不准确。 　　例如：结肠炎意味着结肠的炎症，然而肠易激综合征不会引起炎症的病变。 　　目前采用国际认同的罗马Ⅱ诊断标准对IBS进行诊断: 　　(1)在过去12个月内至少累计有12周(可以是非连续性)存在腹部不适或腹痛;并伴有下列特点中至少2项: 　　① 腹痛或腹部不适在排便后缓解; 　　② 腹痛或腹部不适发生伴随排便次数改变; 　　③ 腹痛或腹部不适发生伴随粪便性状改变。 　　(2)以下症状不是诊断所必备,但属常见症状,这些症状越多越支持IBS的诊断: 　　① 排便频率异常(每天排便>3次或每周<3次); 　　② 粪便性状异常(块状/硬便或稀水样便); 　　③ 粪便排出过程异常(急迫感、排便不尽感、费力); 　　④ 粘液便; 　　⑤ 胃肠胀气或腹部膨胀感。 　　(3) 缺乏可解释症状的形态学改变和生化异常。