(一)发病原因
衣原体感染的传染源是患者及携带者，传播途径主要通过性生活和接触感染者的眼分泌物，新生儿的感染大多来源于分娩时所经产道，其母生殖道衣原体检测往往阳性。
(二)发病机制
衣原体(原始小体)侵入人体后，首先附着宿主上皮细胞表面的外膜受体，通过细胞的吞饮作用进入细胞，进入细胞后原始小体体积增大成网状小体，依靠宿主细胞的营养物质，以二分裂的方式进行增殖成新的原始小体，并形成含有众多原始小体的包涵体(inclusion)，最终包涵体膜胀破，释出原始小体再扩散感染邻近的上皮细胞。衣原体寄生于宿主细胞可直接抑制宿主细胞的代谢，溶解寄生细胞，释放溶酶及各种代谢产物，激发机体的免疫反应造成损伤。由于机体对衣原体的特异性免疫力弱，持续时间短，故衣原体易发生反复持续感染。
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